馆藏的核心是由20世纪60-80年代列宁格勒独立艺术代表的作品组成，其中，通过斯大林主义阵营我们可以划分出当时的“旧彼得宫画派”的参与者亚历山大·巴图林，以及奥西坡·西德林画派的代表人物的安纳托利娅·巴西娜，娜塔莉亚·托列耶娃，弗拉基米拉·奥芙琪尼科娃和安纳托利娅·瓦西里耶娃，他们是1964年艾尔米塔什举办的地下展览《索具展》的参加者。还有格列芭·博格莫洛娃，安纳托利娅·别尔金娜，瓦莲京娜·格拉希门科都曾是1974-1975年在加兹文化馆和“涅夫斯基”文化馆举办的第一届大型“不服从者”展览的参与者。
博物馆的藏品还包括1981年成立的实验造型艺术协会成员的作品。 使用涂鸦形式的新表现主义和青年艺术由“新艺术家”团体成员伊万·索特尼科夫来代表，新宗教绘画的代表是“阿里皮斯”团体成员、艺术家维科（维雅切斯拉夫·扎别林）。博物馆收藏的代表圣彼得堡绘画传统的作品来自以下画家，如菲利克斯·沃罗辛科夫，维雅切斯拉夫·米哈伊尔洛夫，瓦莱里·卢卡，查文·艾尔沙库尼，伊万·乌拉洛夫。博物馆的馆藏中还有插画作品，由不同的工艺制成，出自格奥尔基·科文丘克、叶甫盖尼·乌赫那列夫、伊戈尔·秋里潘诺夫、瓦莱里·米什及其他著名艺术家之手。
馆藏还有一个特殊的部分，是装饰与应用艺术。说到这一部分，就不得不提瓷器制作师莱奥尼德·索科洛夫。博物馆的馆藏中还有康斯坦丁·西蒙、加里娜·多多诺娃、列翁·拉扎列夫的雕塑作品。现代艺术博物馆更是不能缺少已经享有全国和世界声誉的年轻一代的艺术家的作品。他们有伊利亚·加坡诺夫，玛丽娜·科尔陀勃斯卡娅，阿列克谢·亚雷金，塔季扬娜·古巴列娃，玛丽娜·费多罗夫和亚历山大·费多罗夫等等。
在艺术家的馈赠下，还有一批当代外国艺术收藏品，它们是来自意大利、荷兰、爱沙尼亚、美国、波兰以及其他国家艺术家的作品。